【Team 2ch】 Folding@Homeで新型コロナを解析【F@H】

2020/03/31(火) 23:25:19.08

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　　　　　　　　　　　　Folding@Home Distributed Computing
　　　　　　　　　　　　　 http://folding.stanford.edu/
　　　　　　　　　　 _＿＿＿_.～難病治療　　　　　∧,,,∧
　　　　　∧,,∧　　　 |｜＼　　＼　　　のために～( ^ω^　)
　　　　ミ,,ﾟДﾟ彡　　.|｜　|　　　 |　　　　　　　　＿|￣￣||＿）＿
　　　┌‐ﾐつつ／￣|｜／.￣￣/　　　　　／旦|――||/／／|
　　　 |└ヾ,, ,,|二二二」二二二二｣　　　　　|￣￣￣￣￣|￣| │
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　　今すぐ自作PCの有り余るパフォーマンスでたんぱく質研究解析に挑戦だ！

「Folding@Home」　http://folding.stanford.edu/
　目標：タンパク質の折り畳み、凝集およびそれらに関連する病気について理解すること

　タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(折り畳み)をシミュレートし解明するプロジェクトです。
　アルツハイマー病、嚢胞性線維症、BSE(狂牛病)、遺伝型肺気腫などの病気や多くのガンさえもが
　タンパク質が正常に折り畳まれなかった結果だと考えられています。

参加はいたって簡単。
http://folding.stanford.edu/download.html　から各ＯＳ用のクライアントソフトをダウンロードして下さい。
　Windows 98/ME/NT/2000/XP/Vista, Linux(x86/x86_64), Mac OS X(PPC/Intel), PS3 に対応。(FreeBSD/OpenBSDもOK!)
　チーム番号は162です。

2020/03/31(火) 23:45:58.18

【F@H】分散コンピューティングで創薬支援【BOINC】
https://krsw.5ch.net/test/read.cgi/covid19/1585633763/

2020/04/01(水) 04:34:15.16

2020/04/01(水) 17:15:33.69

>>1のURL破綻してるっぽいから興味ある人はこっちの記事見てほしい。

新型コロナウイルスの解析を自分のPCの計算リソースを使って手助けできる「Folding@home」「BOINC」レビュー
https://gigazine.net/news/20200323-folding-home-boinc-coronavirus/

2020/04/01(水) 18:03:05.56

※割と重要な小ネタ

・teamの所に「162」と入れればTeam2chに加入できる。

・標準では1つの課題にCPUの全コアを適宜割り当てて対応するようになっているが
configure→slots→Addを押して出る「CPUｓ」の所の数値「-1（自動割り当て）」を「1」や「2」にしてOKを押すと
CPU使用数を限定して課題を処理できる。
同時に、現在はこのスロット数を増やしている方が課題が落ちてきやすい。
（GPU側は詳しい人以外はそのままで）

・configure→identity→passkeyの所の「click here to～」を押すといわゆるユーザー登録が行え、
完了した時にもらえるpasskeyを入力すると（reenterは確認のため同じのをコピペ）
課題が落ちて来やすくなる。

※対コロナに限らず研究者達が分散型コンピューティングに対して理想としているのは
『どこまで積み重なるかも分からないフェーズ数に対し、大人数から長期的に微力を貸し続けて貰う』事であり
一つのフェーズに瞬間的に大パワーを注ぎ込む事ではない。

初心者はどうしても短期的なポイント獲得率で成果を見出しがちになってしまい、
なかにはフルパワーで回して電気代やパーツの損耗の問題から早期脱落する事があるが、
その人物が全力を掛けて援助したフェーズは失敗に終わったり、コロナ撲滅に直接役立つフェーズはもっと後にあったりしてもおかしくないため
そういった短期脱落のパターンは「頭数」と「貴重な演算能力」の両方を失う最も避けたい状態なので気をつけてほしい。

2020/04/01(水) 18:09:37.64

passkey補足

615 名無しさん sage 2020/03/29(日) 04:25:03.83 0
あとpasskeyって項目があった・・
画面左上のコンフィグからアイデンティティタブ、その下にpasskeyの項目、すぐ下にリンク
そのリンクから自分の名前とメアドを入力してやれば、そのメアドにパスが届く
そいつをアイデンティティの下の方にある縦に並んだ２つの空欄に右クリックからペーストで貼り付け
あとはsaveで保存したら認証終了で、宿題もすぐ降ってきたしスコアもわけわからんくらい増えた

ミディアム運用でせいぜい６桁が10倍の7桁になった、、、　みんなもやってみ？
https://i.imgur.com/rCCw3Bo.jpg

2020/04/01(水) 18:37:49.10

昨日迄順調に順位を上げてましたが　今日は下がりました　強力な新参が増えて嬉しいです

2020/04/01(水) 23:15:21.57

微力ながら参加します

2020/04/02(木) 16:57:12.53

ubuntuに導入したいのですが
分かりやすいサイトがあれば教えて下さい

2020/04/02(木) 17:32:34.41

>>9
https://blog.n-z.jp/blog/2020-03-06-foldingathome.html
こんな感じ？
とにかくfahclientをダウンロードしてインストールすれば動くと思う

2020/04/04(土) 13:01:49.66

age

2020/04/04(土) 13:02:09.87

あがってねえわ

2020/04/04(土) 22:25:16.95

>>9
apt update && apt upgrade -y
apt install wget -y
wget https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahclient/debian-stable-64bit/v7.5/fahclient_7.5.1_amd64.deb
dpkg -i --force-depends fahclient_7.5.1_amd64.deb
apt-get autoremove -y
apt install ocl-icd-opencl-dev -y
# 以下は必要に応じて
# 1～2分放置してから
vi /etc/fahclient/config.xml
systemctl restart FAHCleint

2020/04/04(土) 22:33:21.16

意味がわからんんんんんーーーーーーー
？

2020/04/05(日) 11:24:18.02

>>9
無理してコマンド打つ必要ないよ。
公式サイトのダウンロードからクリックしていくだけ。
https://foldingathome.org/start-folding/
インストール後、アプリ一覧からFAHで始まるそれらしいアイコン見つけて起動。
画面で色々設定できる。

2020/04/05(日) 11:28:07.74

あ、いや、クリックしていくだけでなかった。
確か依存関係の何かを入れなきゃいけなかった記憶が。

>>13
--force-depends これ付けん方がいいよ。ちょっとaptが壊れてハマった。

2020/04/05(日) 22:07:10.56

2週間くらい一人でやってたけど、2chチーム再編成したと聞いて戻って来ましたよー
PS3勢も戻ってきてるみたいで懐かしい！

2020/04/05(日) 22:15:23.35

チーム番号3桁とかいう古参っぷりよ

2020/04/06(月) 00:03:02.76

Folding@Homeでコロナも解明 Part6【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1585735854/
こっちのスレものぞいてみてね

2020/04/06(月) 00:30:44.27

サンキュー
そっちの方がメインになってるね。
覗いてみます。

2020/04/06(月) 06:50:32.42

こっちも伸ばしたいんだけどね

2020/04/06(月) 07:10:16.24

今からでもPS3で始められますか？

2020/04/06(月) 07:45:32.81

PS3はもうかなり昔に終わったよ

2020/04/06(月) 22:45:12.42

age

2020/04/07(火) 00:20:52.65

>>22
8年前に終わったよ

2020/04/07(火) 06:38:01.19

age

2020/04/07(火) 08:04:37.24

支援 age

2020/04/08(水) 09:03:35.87

支援age
ついでにboincのrosseta@homeにも来てくれ
人手が足りねぇ

【Team 2ch】分散コンピューティング総合320【UD→BOINC】
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/entrance/1569472943/

2020/04/08(水) 10:09:15.43

WCGにも来るらしいから今より戦力が必要になる

2020/04/08(水) 12:51:40.70

重複スレ再利用のため、PC板の次スレはこちらになりました。

Folding@Homeで難病解明 Part6【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1585743584/

2020/04/09(木) 09:32:06.30

https://i.imgur.com/kqfp8LG.jpg

2020/04/10(金) 02:09:00.47

age

2020/04/10(金) 03:04:41.66

Celeronで参戦age

2020/04/13(月) 00:32:07.06

いい機会だから新しいPC作ろうかな。もしくはJetson Nano買って放置プレイするか

2020/04/14(火) 11:33:44.64

age

2020/04/14(火) 19:17:52.74

PC板の次スレはコチラ

Folding@Homeで難病解明 Part8【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1586843415/

2020/04/17(金) 17:53:22.90

boincが更新されました
F@Hで物足りないヤツはこっちも参加してくれ

【Team 2ch】分散コンピューティング総合321【UD→BOINC】
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/entrance/1587083021/

2020/04/18(土) 14:23:24.90

Folding@homeのクライアントのバージョンが7.6.9に上がったからアップデート推奨
コロナしかやらないモードと重要な事を先にやるモードが追加されたよ

2020/04/20(月) 01:36:45.97

たすかる

2020/04/20(月) 13:47:58.29

7.6.9
Windows版は普通に上書きインストール
Ubuntu/CentOS7はFAHClientを停止して上書きインストール
それぞれ、データは引き継がれました。
FAHControlで宿題の種類をCOVID-19にするか、config.xmlに

<cause v='COVID_19'/>
を追加するようです。

2020/04/20(月) 13:49:40.37

>>40
CentOS7の上書きに失敗したときは、rpm -e で7.5.1を一旦消してから7.6.9をrpm -iしてください。

2020/04/21(火) 08:18:26.48

F@Hスレが更新されますた

Folding@Homeで難病解明 Part9【FAH】
https://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1587377692/

2020/04/21(火) 14:54:12.59

あげ

**名無しのアビガン**(茸) (ｽｯﾌﾟ Sd02-fjqD) · 2020/04/27(月) 16:54:30.18

支援age

2020/05/02(土) 19:39:02.26

PC板のスレが更新されたぞ

Folding@Homeで難病解明 Part10【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1588372370/

2020/05/07(木) 00:49:29.07

>>45
↑パソコン一般板のほうは、ID出ないから
自由に発言できるぞ
現在世界順位32位

2020/05/07(木) 00:50:18.06

あげ

2020/05/09(土) 11:19:19.68

age

2020/05/09(土) 16:44:56.85

次スレ

Folding@Homeで難病解明 Part11【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1588984623/

2020/05/10(日) 08:30:46.64

age

2020/05/11(月) 21:34:19.69

age

**名無しのアビガン**(茸) (ｽｯﾌﾟ Sd2a-yY2D) · 2020/05/11(月) 21:57:47.69

支援age

2020/05/14(木) 23:40:48.66

age

2020/05/17(日) 02:53:04.41

age

2020/05/18(月) 20:02:07.66

【分散コンピューティング】コロナウイルス解析後押しスパコン500基分、新薬開発に挑む
https://asahi.5ch.net/test/read.cgi/newsplus/1589794582/

2020/05/19(火) 22:49:35.25

一般パソコン板のスレが更新されました

Folding@Homeで難病解明 Part12【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1589886655/

2020/05/20(水) 17:42:29.86

Microsoft Buildのナデラ氏の話を聞いて久しぶりに参戦します。20年ぶり。よろしくお願いいたします。

2020/05/20(水) 18:03:58.17

>>57
>>56のスレにも来てね

2020/05/20(水) 18:54:52.12

>>57
これか
Today during #MSBuild, F@h director @drGregBowman and @Microsoft CEO @satyanadella chatted about our work tackling #COVID19 (and beyond) with the power of distributed computing! Check out the conversation starting at 14:14 #AIforHealth
https://twitter.com/foldingathome/status/1262866900482220037?s=19
https://twitter.com/5chan_nel (5ch newer account)

2020/06/06(土) 12:27:40.09

最近スコア低いGPUタスク多いな
タスクによってPPD換算12倍くらい変わるんだが

2020/06/06(土) 12:28:31.63

書くスレ間違えたぞ（間違ってないけど）

2020/06/13(土) 16:21:41.04

PC板のスレが更新されますた

Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/

2020/06/14(日) 07:42:26.48

良いスレあげ

2020/06/18(木) 22:40:37.33

あげ

2020/06/20(土) 08:05:52.00

あげ

2020/06/23(火) 20:55:27.86

age

2020/06/27(土) 07:29:51.95

Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
https://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/

2020/07/03(金) 20:48:09.76

Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/

2020/07/18(土) 07:41:23.18

age

2020/07/24(金) 07:47:46.46

age

2020/07/28(火) 13:36:14.77

コロナ壊滅のため、FAHに参加を
所属チームは2ch（番号162）

Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/

2020/08/08(土) 20:29:17.55

コロナ壊滅のため、FAHに参加を
所属チームは2ch（番号162）

Folding@Homeで難病解明 Part14【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1596765657/

2020/08/09(日) 23:17:35.13

あげ

2020/08/16(日) 08:32:32.49

age

2020/08/18(火) 22:37:28.15

age

2020/08/26(水) 22:29:17.36

コロナ壊滅のため、FAHに参加を
所属チームは2ch（番号162）

Folding@Homeで難病解明 Part14【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1596765657/

2020/09/04(金) 23:32:40.79

age

2020/09/12(土) 14:13:11.94

今f@hのために中古パーツのSundayだがマシン組んでるぞ！
マザー壊したので遅れてるがｗ
無事に組み上がったら全力運転するぜ

2020/09/18(金) 08:58:05.67

>>78
同志よー　待ってるぞ！

2020/09/18(金) 09:44:14.21

WCGもよろしくね

2020/10/19(月) 21:30:49.43

Folding@Homeで難病解明 Part14【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1596765657/

2020/10/26(月) 19:44:34.07

暖房つけるまでもないけど、PCの排熱くらい欲する肌寒さ。
よって半年ぶりに再参加なう

2020/10/29(木) 02:52:00.19

排熱の有効利用って考えたら夏よりも冬にやる方が環境にも優しいやね

2020/11/26(木) 23:05:23.21

Folding@Homeで難病解明 Part15【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1604733903/

2021/01/18(月) 06:49:21.99

はじめまして。
新型コロナ対策にヤシマ作戦をしようと思い、久しぶりの参戦です。
お手柔らかにお願いしますm(_ _)m

2021/01/18(月) 07:15:27.89

>>85
F@H？WCG？

2021/01/23(土) 00:19:15.82

>>85
見てないけどテレビの影響ですね

2021/02/06(土) 12:14:44.62

41 名前：名無しさん？[sage] 投稿日：2021/02/06(土) 09:31:45.99 ID:???
OpenPandemicsの月例報告
https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=680
以下はググる翻訳

OpenPandemics-COVID-19は、潜在的なCOVID-19治療法の検索を加速するために作成されました。
このプロジェクトはまた、将来のパンデミックが発生した場合にすべての科学者が治療法を
すばやく検索できるようにする、迅速な対応のオープンソースツールキットの構築を目指しています。

2020年後半に、研究者たちは、COVID-19を引き起こすウイルスの潜在的な阻害剤として調査することが期待できる
70の化合物（約20,000の元のグループから）を選択したと発表しました。

ラボテストを受けている化合物の最初のセット

上記の70のグループのうち、研究者は最近、最初の25の有望な化合物を注文してラボの共同研究者に送り、
ラボのテストプロセスが開始されました。生物学的検査の結果に関する最新情報があり次第、お知らせします。

GPU用OpenPandemics

研究アプリケーションコードをGPUに移植するプロセスは順調に進んでおり、
ボランティアに送信する前にワークユニットが適切かつ安全に機能するように取り組んでいます。
コードのセキュリティレビューが完了しました。

ワークユニットの現在のステータス

ダウンロード可能：6,025バッチ
進行中：2,528バッチ（17,384,490作業単位）
完了：30,576バッチ
過去30日間で3,098バッチ
1日あたり平均103バッチ
推定バックログ：58日

2021/04/25(日) 19:27:31.47

Folding@Homeで難病解明 Part16【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1613357806/

2021/06/10(木) 19:21:40.56

Folding@Homeで難病解明 Part16【FAH】
http://medaka.2ch.net/test/read.cgi/pc/1613357806/

2021/06/10(木) 19:31:56.62

新型コロナウィルスとワクチンに関する疑念

中華人民共和国は
世界中へ新型ウィルスを蔓延させて
更に対策用ワクチンを大規模接種させる事により
非黄色人種（特に白人など）を根絶やしにする謀略
を実行している。

新型ウィルス蔓延の意図

新型ウィルスは武漢ウィルス研究所で
人種選択型重症化ウィルスとして
遺伝子操作により合成された。
このウィルスは非黄色人種に感染すると
重症化し易く、膨大な数の死者を出させている。
つまり今、生存している非黄色人種を絶滅出来る。

まず中国人自身への影響を確認するため
このウィルスを、最初に武漢の市場へ
ばら撒き、被害程度を調査しながら
全世界へ感染拡大させた。

その証拠に、人口１４億人もある中国が
最近の発表でも「累計感染者数は、
約10万人で、累計死者数は、5000人程度」と
被害が非常に軽微であるという現実がある。

ワクチン大規模接種の意図

ワクチンを開発製造している
ファイザー社、アストラゼネカ社、
モデルナ社などは、多国籍企業であり、
多数の中国人を雇っている。

それら中国人研究員達が作成した
「遺伝子組み換え型」のワクチンは
短期的には見かけ上、免疫効果が現れるが
長期的には、人体の生殖細胞へ悪影響して
子孫に奇形や障がいを多発させるか
不妊となるように遺伝子操作されている。
つまり欧米等の各国が推進して、
ワクチン接種した人達の子孫を
根絶やしに出来る。

従って十数年後に、地球上は
中国人だらけになり、
その陰で、日本人や韓国人などが
ひっそり暮らしている事態に
なっているかも？？？

もともと中華人民共和国という
国名にある「中華」には
自分たちが世界の「中心」となり
周辺の国々から富を吸い上げて
「栄華」を極めるという意味が
込められている。

【Team 2ch】 Folding@Homeで新型コロナを解析 【F@H】

【Team 2ch】 Folding@Homeで新型コロナを解析【F@H】